조계종에 이어 진각종도 북한의 연평도 포격과 관련해 우려의 성명을 발표했다. 진각종은 24일 발표한 통리원장 혜정 정사 명의의 논평문을 통해 “11월 23일, 한반도 서쪽 연평도에서 울린 포화의 소리는 소중한 해병대원 2명의 생명을 앗아가고, 다수의 군인과 민간인이 다치는 분단 민족의 뼈아픈 현실로 다가왔다”며 “먼저 진각종 종도는 돌아가신 두 장병과 그 가족에게 깊은 애도의 뜻을 전하고, 아울러 부상당한 모든 분들의 쾌유를 기원한다”고 밝혔다.

진각종은 또 “서로 생각하는 바가 다르고, 처한 입장이 다르다고 하여도 생명은 인류의 소중한 가치이자, 있는 그대로의 부처님 성품이기에 그 어떠한 논리로 위협되거나 훼손되어서는 안 된다는 것을 다시금 강조한다”며 “한반도의 평화와 안녕을 위해 진호국가불사(鎭護國家佛事)의 참뜻을 수행으로 이어 분단이라는 치우친 어리석음을 극복하고, 한민족이라는 생명과 역사의 동일성이 하나 된 진리로 구현되기를 서원한다”고 밝혔다.